Αρχικά, η εκκλησία της Santa Maria ιδρύθηκε ως ενοριακός - αμέσως μετά την ίδρυση του Trujillo (1.535 με 1540). Στο 1616 η εκκλησία ανυψώθηκε στο αξίωμα του καθεδρικού ναού από τον Πάπα Παύλο V, αλλά τρία χρόνια αργότερα καταστράφηκε μαζί με όλη την πόλη από το σεισμό του Φλεβάρη 1619. Αναπαράσταση του ναού ανατέθηκε Bartolomeo de las Cuevas. Αλλά αυτό το κτίριο της εκκλησίας δεν κατάφερε να επιβιώσει τον καταστροφικό σεισμό στην Φεβρουάριος 1635. Το 1647 η επισκοπή αντιδρούσαν πιο σοβαρά με την κατασκευή του κτιρίου εκκλησία σχεδιάστηκε από τον αρχιτέκτονα Francisco de Soto Rios, από την οποία αποφοίτησε το 1666. Φρανσίσκο Balboa. Προς το παρόν, οι αρχιτέκτονες προσπάθησαν να παρέχουν όλα τα απαραίτητα μέτρα για τη σταθερότητα των κτιρίων ώστε να αντέχουν σεισμούς στο μέλλον ακτή του Περού.

Το 1967, ο Πάπας Παύλος VI αυξημένα την εκκλησία του καθεδρικού ναού, αλλά το 1970, λόγω του σεισμού, ο ναός ήταν η σοβαρές ζημιές: τον τρούλο, το καμπαναριό και το βωμό. Δύο δεκαετίες αργότερα, το κτίριο του καθεδρικού ναού αποκαταστάθηκε πλήρως.

Καθεδρικός Ναός της Σάντα Μαρία είναι διάσημη για το βωμό του - το τεράστιο λευκό βωμό στο μπαρόκ και ροκοκό είναι καλυμμένο με φύλλο χρυσού, διακοσμημένα με πολύτιμους εικόνες και τα εικονίδια των πλοιάρχων των σχολείων τέχνης του Cusco και το Κίτο. Ομορφιά και τη μοναδικότητα του μπορεί να συγκριθεί μόνο με τον βωμό στον καθεδρικό ναό του Κούσκο.

Οι επισκέπτες μπορούν να δουν τον καθεδρικό ναό Trujillo μεγάλη συλλογή από αρχαίες εικόνες που διακοσμούν: οι εικόνες του Αγίου Rosa, St. Τερέζα της Άβιλα, St. Πέτρος, Άγιος Ο Ιωάννης ο Βαπτιστής, St. Toribio de Mogroveho, St. Βαλεντίνα. Τα τόξα και οι τοίχοι του ναού κοσμείται με τοιχογραφίες που απεικονίζουν τους Αποστόλους, παράθυρα - βιτρό.

Καθεδρικό Ναό Μουσείο, που βρίσκεται μέσα στο ναό κατέχει πολύτιμα θρησκευτικά έργα τέχνης. Ιδιαίτερα πολύτιμα έργα ζωγραφικής και γλυπτικής της σχολής του Κούσκο και αντικείμενα της αποικιακής περιόδου, συμπεριλαμβανομένων δύο πίνακες: ". Ο Ιωάννης ο Βαπτιστής" "άρνηση του Πέτρου» και

Δίπλα στον καθεδρικό ναό είναι το Παλάτι του Αρχιεπισκόπου.