Χανιά χτίστηκε από τους Βενετούς στις αρχές του XIII αιώνα στο χώρο του αρχαίου οικισμού της Κυδωνίας. Αποδεικτικά στοιχεία αυτής της εποχής είναι το ένα τέταρτο στην παλιά πόλη με αξιόλογα ενετικά κτίρια και οχυρώσεις στην περιοχή του λιμανιού με τα υπέροχα φάρος, ο οποίος σήμερα είναι συγκεντρωμένα διοικητικό, πολιτιστικό και τουριστικό κέντρο. Η πόλη παρέμεινε μέρος της οχύρωσης - προμαχώνες, την τάφρο, τα λείψανα των αμυντικά τείχη.

Αρχαιολογικό μουσείο της πόλης βρίσκεται στην ενετική εκκλησία του Αγίου Francis. Υπάρχουν εκθέματα που βρέθηκαν στη δυτική Κρήτη και σε άλλες περιοχές του νησιού, που σχετίζονται με ιστορικές περιόδους, από τη Νεολιθική μέχρι τη Ρωμαϊκή περίοδο, συμπεριλαμβανομένων των αγαλμάτων και ειδωλίων, όπλα, κεραμικά, λίθινες σφραγίδες, νομίσματα, κοσμήματα, και πολλά άλλα.

Η πόλη είναι το Ιστορικό Αρχείο της Κρήτης με την πλούσια συλλογή του υλικού από την ιστορία του νησιού, εθνογραφική έκθεση - το δεύτερο μεγαλύτερο ιστορικό μουσείο της χώρας.

Ναυτικό Μουσείο Κρήτης βρίσκεται στο λιμάνι. Τα εκθέματά του πω για την ένδοξη ιστορία της πόλης.