Το 1953, η Εταιρία Κρητικών Ιστορικών Μελετών ιδρύθηκε Ιστορικό Μουσείο Κρήτης. Το μουσείο στεγάζεται σε ένα νεοκλασικό κτίριο, που χτίστηκε το 1903 και ανήκε στην οικογένεια Καλοκαιρινού. Το 1952, ο Ανδρέας Καλοκαιρινός παρέδωσε το κτίριο στην Εταιρεία Ιστορικών Μελετών του μουσείου.

Η έκθεση, που παρουσιάστηκε στο μουσείο καλύπτει ένα μεγάλο χρονικό διάστημα, αρχίζοντας από την πρώιμη χριστιανική εποχή στην Κρήτη, και μέχρι σήμερα. Ο κύριος στόχος των ιδρυτών του μουσείου ήταν η συγκέντρωση και διαφύλαξη ενός πολύτιμου αρχαιολογικού, εθνογραφικού και ιστορικού υλικού. Η συλλογή του μουσείου έχει εμπλουτιστεί σταδιακά, επεκτάθηκε το μουσείο (στο κεντρικό κτίριο συνδέθηκε μια νέα πτέρυγα σε ένα μοντέρνο στυλ). Το μουσείο έχει εμπλακεί σε δραστηριότητες έρευνας και των εκδόσεων, κατέχει προσωρινές εκθέσεις και διάφορα εκπαιδευτικά προγράμματα.

Επισκεφτείτε το μουσείο αρχίζει με Α Καλοκαιρινός αίθουσα, η οποία παρουσιάζει μια επισκόπηση έκθεση της ιστορίας της Κρήτης. Η κύρια αίθουσα εκθεμάτων είναι ένα μοντέλο της πόλης του Ηρακλείου, στα μέσα του 17ου αιώνα (η κορύφωση της δημοτικότητας των ενετικών ισχύος) μέτρων 4x4. Περαιτέρω, οι τεράστιες συλλογές του μουσείου παρουσιάζονται σε χρονολογική σειρά και με τα θέματα. Η έκθεση περιλαμβάνει τα κεραμικά μουσείο, γλυπτά, κοσμήματα, τοιχογραφίες, χαρακτική, φορητές εικόνες, χειρόγραφα και τελετουργικά αντικείμενα, όπλα και άλλα. Θα πρέπει επίσης να αναδεικνύει την πλούσια νομισματική συλλογή, που παρουσιάζει νομίσματα, μετάλλια, εκτύπωση και αρχειοθέτηση των εγγράφων που αντικατοπτρίζει όλες τις φάσεις της κρητικής οικονομικής ιστορίας από την πρώιμη χριστιανική περίοδο ως και τον 20ο αιώνα.

Οι πολύτιμοι λίθοι της συλλογής του μουσείου, είναι οι πίνακες του διάσημου ζωγράφου Ελ Γκρέκο "Άποψη του Όρους και της Μονής Σινά της Αγίας Αικατερίνης» (1570) και "Η Βάπτιση του Χριστού (1567). Είναι το μόνο έργο του καλλιτέχνη της Κρήτης.

Ιδιαίτερο ενδιαφέρον παρουσιάζει μια έκθεση αφιερωμένη στη ζωή και το έργο του διάσημου Έλληνα συγγραφέα Νίκου Καζαντζάκη, η οποία περιλαμβάνει προσωπικά αντικείμενα, χειρόγραφα και πρώτες εκδόσεις των έργων του σε διάφορες γλώσσες. Καλά φωτισμένο και σύγχρονη ιστορία της Κρήτης, με ιδιαίτερη έμφαση στα επαναστατικά γεγονότα του 19ου αιώνα και τον Δεύτερο Παγκόσμιο Πόλεμο. Εθνογραφική Συλλογή του Μουσείου θα εξοικειώσει τους επισκέπτες με τη ζωή και τις παραδόσεις των κατοίκων της Κρήτης. Η ενότητα αυτή παρουσιάζει το ανακαινισμένο εσωτερικό του αγροκτήματος.

Στη βιβλιοθήκη του Ιστορικού Μουσείου φυλάσσονται σπάνιες εκδόσεις, περιοδικά, αρχεία τοπικών εφημερίδων, μια πλούσια συλλογή από ιστορικά αρχεία και φωτογραφίες. Η βιβλιοθήκη έχει ως στόχο τόσο το ευρύ κοινό και τους ερευνητές.