Στο κέντρο του Ηρακλείου, κοντά στο Αρχαιολογικό Μουσείο είναι ένα Μουσείο της Μάχης της Κρήτης. Το μουσείο ιδρύθηκε από τον Δήμο Ηρακλείου το 1994 και αφιερωμένο στην άμυνα της Κρήτης και της λαϊκής αντίστασης κατά τη διάρκεια του Δευτέρου Παγκοσμίου Πολέμου. Σκοπός του μουσείου είναι η συλλογή, την προστασία και την επίδειξη ιστορικά κειμήλια 1941-1945 σωστά, καθώς και την τεκμηρίωση και τη διάδοση των πληροφοριών σχετικά με τους αγώνες του λαού κατά τη διάρκεια της Μάχης της Κρήτης και της γερμανικής κατοχή.

Η μουσειακή έκθεση παρουσιάζει χιλιάδες πρωτότυπες φωτογραφίες, έργα ζωγραφικής και σχέδια της Μάχης της Κρήτης και της λαϊκής αντίστασης, περίπου 200 βιβλία, μονογραφίες, δοκίμια ιστορικά γεγονότα 1941-1945, εκατοντάδες έγγραφα και άρθρα εφημερίδων. Το μουσείο παρουσιάζει επίσης μια ποικιλία θεμάτων που σχετίζονται με τον πόλεμο: όπλα, σχήμα, διάφορα αξεσουάρ, είδη οικιακής χρήσης και πολλά άλλα.

Το μεγαλύτερο μέρος των εκθεμάτων καλύπτει την "Μάχη της Κρήτης" Μάιος 1941. Η μάχη αυτή είναι μία από τις μεγαλύτερες στην ιστορία των αερομεταφερόμενων λειτουργίας Β 'Παγκοσμίου Πολέμου και είναι επίσης γνωστή ως «Επιχείρηση Ερμής». Ο κύριος στόχος των Γερμανών κατακτητών ήταν η μετατόπιση του Ηνωμένου Βασιλείου από τη Μεσόγειο Θάλασσα και την καθιέρωση του στρατηγικού ελέγχου πάνω από τη λεκάνη της Μεσογείου. Ο διοργανωτής της πολιτοφυλακής του λαού ήταν ένας Βρετανός αρχαιολόγος που εργάστηκε για βρετανικές μυστικές υπηρεσίες, ο John Pendlebury. Παρά τις πολυάριθμες απώλειες, οι Γερμανοί κέρδισαν τη μάχη.

Το μουσείο έχει το δικό του ερευνητικό κέντρο, όπου το προσωπικό επικεντρώθηκε στη συλλογή του αρχειακού υλικού του πολέμου από διάφορες χώρες (1940-1945) και η μετάφρασή τους. Οι δραστηριότητες του μουσείου έχει ως στόχο την προσέλκυση της προσοχής της νεότερης γενιάς στην ιστορία του Κρητικού λαού και την ευαισθητοποίηση της καταστροφικής δύναμης του πολέμου.